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BiodivMapR

BiodivMapR: un package R pour la cartographie de la diversité α et β à l’aide d’images de télédétection.

BiodivMapR

Aperçu

BibiodivMaR est un package R permettant de produire des cartes d'indicateurs de diversité a partir de l'information contenue dans des données d'imagerie optique, telles que l'imagerie hyperspectrale, et les images collectées par les satellites Sentinel-2.
Le package a été initialement développé pour l’étude des forêts tropicale, mais son application a d'autres types de milieux s'est avérée prometteuse.
Les indicateurs de diversité sont calculés a partir de l'hétérogénéité spatiale de l'information spectrale (Spectral Variation Hypothesis), et ont montré une bonne concordance avec les informations recueillies sur le terrain par le biais d'inventaires forestiers. les indicateurs de diversité calculés sont associés aux composantes α et β de la biodiversité, et permettent de cartographier l'indice de Shannon et la dissimilarité de Bray-Curtis.

 

Jean-Baptiste Féret & Florian de Boissieu
ont développé un package R permettant de produire des cartes de biodiversité a partir de d'images de teledetection, notamment des données Sentinel-2.

 

Les instructions pour l'installation et un tutoriel de biodivMapR sont disponibles sur gitHub et le package est présenté dans la derniere parution de Methods in Ecology and Evolution.